Podczas wojny Niemcy rozstrzelali prawie cały zakon, ocalała tylko ona. Po wojnie radzieckie władze na Białorusi prowadziły działania, by pozbawić Polaków możliwości wyznawania wiary. Siostra Małgorzata robiła wszystko, by pomóc wierzącym i podtrzymywała w nich ducha religijnego.
Zmarła w 1966 roku. Siostry nazaretanki podjęły starania o rozpoczęcie jej procesu beatyfikacyjnego, na co Watykan zgodził się w 2002 roku.