Igrzyska Europejskie odbyły się blisko dwa lata temu. Impreza miała przynieść rozgłos naszemu regionowi, tymczasem według Najwyższej Izby Kontroli wydano na nią ze środków publicznych co najmniej miliard siedemset milionów złotych, a przy tym doszło do wielu nieprawidłowości. Mimo że od imprezy minęło tyle czasu, spółka nadal nie zamknęła wszystkich rozliczeń i nie podjęto działań zmierzających do jej zamknięcia.
Według raportu Najwyższej Izby Kontroli opublikowanego w lutym 2025 roku, organizacja Igrzysk Europejskich napotkała liczne nieprawidłowości. NIK wskazała na brak pełnych analiz kosztów i korzyści związanych z organizacją igrzysk przez kluczowe podmioty, w tym Spółkę Igrzyska Europejskie 2023. Ponadto, stwierdzono nieprawidłowości finansowe, takie jak zawyżenie opłaty za prawo do organizacji zawodów o co najmniej 2,5 mln zł oraz opóźnienia w rozliczeniach z kontrahentami na kwotę niemal 54 mln zł.
NIK złożyła zawiadomienie do prokuratury o podejrzeniu przestępstwa wyrządzenia Skarbowi Państwa szkody majątkowej wielkich rozmiarów między innymi przez prezesa i wiceprezesa zarządu spółki.
Spółka Igrzyska Europejskie 2023 Sp. z o.o. została powołana w listopadzie 2021 roku przez Województwo Małopolskie, a w listopadzie 2022 roku dołączyła do niej Gmina Miejska Kraków.