WiN to pierwsza poakowska organizacja, która kontynuowała działalność Armii Krajowej metodami politycznymi jak wywiad, propaganda i w ostateczności działania zbrojne w samoobronie - przypomina zastępca dyrektora krakowskiego oddziału IPN Michał Wenklar.
Działacze WiN-u w procesie krakowskim oskarżono o prowadzenie działalności wywiadowczej na rzecz obcych mocarstw oraz terroryzowanie członków Polskiej Partii Robotniczej. PSL-owcom z kolei zarzucano świadomą współpracę z nielegalnym podziemiem.