Autor wielu publikacji poświęconych Pismu Świętemu i dialogowi chrześcijańsko-żydowskiemu,  ceniony przewodnik po Ziemi Świętej oraz innych krajach biblijnych.
Szczegółowe zainteresowania ks.prof.Chrostowskiego to diaspora Izraelitów w Asyrii (VIII-VI w. przed Chr.); prorok Ezechiel i jego księga; geneza, natura i teologia Septuaginty jako Biblii Greckiej; rozejście się dróg Synagogi i Kościoła; dialog Kościoła katolickiego z Żydami i judaizmem.